La última gran campaña de Alianza Lima en la Copa Libertadores fue en el 2010, donde avanzó hasta octavos de final. José Carlos Fernández estuvo presente en aquel equipo que estuvo muy cerca de pasar a instancias finales.
De acuerdo a ‘Zlatan’ Fernández lo que caracterizaba a ese Alianza Lima era creer mucho en sus posibilidades. Uno de los míticos encuentros de aquella campaña fue ante el campeón de la Libertadores, los ‘blanquiazules’ vapulearon 4-1 a Estudiantes de La Plata en Matute.
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La gran historia terminó antes de lo esperado. Un polémico gol sobre el final de la 'U' de Chile dejó fuera a Alianza Lima de la Copa Libertadores. El conjunto de Matute no volvió a pasar a octavos de final de dicho torneo en los últimos 10 años.
"Contra la ‘U’ de Chile nos faltaba un gol para pasar (a cuartos de final) en la Libertadores y lo logramos, pero luego hubo un error del árbitro”, manifestó José Carlos Fernández para Gol Perú.
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El paso del delantero de Alianza Lima estuvo marcado por más de un mal momento. En el 2009 y en el 2011 perdió finales con la camiseta ‘blanquiazul’; la primera ante el clásico rival y la segunda ante Juan Aurich.
"La final del 2009 me dolió más porque hicimos un esfuerzo más grande que en el 2011. La ‘U’ llegaba más descansado y a nosotros se nos cayó Forsyth, Corzo, Velásquez. Con tanto lesionado tocó todo lo que se venía haciendo”, puntualizó José Carlos Fernández.