Antes de concluir la primera temporada de su serie de anime, la revista semanal Shonen Jump de Shueisha habló acerca del futuro que le esperaba a Dr. Stone. Los fanáticos esperaban que con el final de la primera temporada, la serie tuviera una segunda en proceso.
Finalmente en los últimos minutos del capítulo 24 confirmó la segunda temporada además de mostrar un primer avance de la temporada 2 que desarrollará el arco de ‘Stone Wars’, la guerra entre el Reino de la Ciencia de Senku y el Imperio Tsukasa.
El episodio 24 de la serie puso fin a la primera temporada, y Senku logró concluir con todos los preparativos para le pelea antes que termine el invierno. Con la nieve derritiéndose, es hora de que las dos aldeas entren en guerra entre sí y ahora el joven científico con el resto de la Aldea Ishigami están listos para la batalla próxima.
Originalmente creada por Riichiro Inagaki con ilustraciones proporcionadas por Boichi para la Shonen Jump semanal de Shueisha en 2017. "Varios miles de años después de un misterioso fenómeno que convierte a toda la humanidad en piedra, el niño extraordinariamente inteligente y científico, Senku Ishigami, despierta. Frente a un mundo de piedra y el colapso total de la civilización, decide usar la ciencia para reconstruir el mundo. Comenzando con su súper fuerte amigo de la infancia Taiju, quien despertó al mismo tiempo, juntos intentarán reconstruir la civilización de la nada ¡Representando dos millones de años de historia científica desde la Edad de Piedra hasta nuestros días, la historia de aventuras de creación sin precedentes está por comenzar! "