Entre las regiones, Cusco es la única que concentra tres equipos en la Liga 1, torneo de primera división que, actualmente, registra 19 clubes de todo el país, con cuatro de estos en la capital, Lima. Respecto a la región imperial, figuran Cienciano, uno de los más laureados, seguido de Cusco FC, el club más joven, y Deportivo Garcilaso.
Cienciano, para este 2023, logró permanecer en la Liga 1 y aunque no disputó el titulo nacional, sí consiguió hacerse de un lugar para jugar en la Copa Sudamericana. Por su parte, Cusco FC volvió a la primera división luego que el 2022 fuera desembarcado del proceso sorpresivamente. A pesar de la situación adversa, la directiva decidió pasar a la Liga 2 con su plantilla original, por lo que se convirtieron en campeones del torneo con 18 victorias de 24 cotejos, lo que le permitió volver al torneo máximo. Finalmente, la gran sorpresa la daría Deportivo Garcilaso, que subió a la división profesional tras convertirse en campeón de la Copa Perú.
De los tres clubes cusqueños, actualmente, el de mayor cotización, de acuerdo a la página de transferencias Transfermarkt, es Cusco FC. Le sigue Cienciano y luego Deportivo Garcilaso; sin embargo, hay que precisar que este último es el que hizo una mayor inversión a nivel nacional para potenciar su plantilla.
Según Transfermarkt Cusco FC cuesta en 8 millones 500 mil euros, siendo su zaga la de mayor precio con más de 3 millones de euros. Respecto a sus jugadores mejor cotizados en el mercado figuran:
Respecto al Papá de América, según Transfermarkt se cotiza en 8 millones 330 mil euros. En este caso, su delantera es la de mayor costo con 2 millones 980 mil euros. En cuanto a sus jugadores de mayor valor en el mercado figuran:
En cuanto al recientemente ascendido Deportivo Garcilaso, según Transfermarkt, se cotiza en 6 millones 850 mil euros, en tanto que su delante cuesta 2 millones 550 mil euros. Sus jugadores mejor cotizados son: